A região amazônica brasileira abriga diversas comunidades formadas por descendentes de escravos africanos, algumas das quais ainda relativamente isoladas. Nós estudamos duas dessas comunidades (Pacoval e Curiau), localizadas na área rural do município de Alenquer, Pará, e na região metropolitana de Macapá, Amapá, respectivamente. Entre os 12 loci investigados, alelos considerados como marcadores de ancestralidade africana, tais como HBB*S, HBB*C, TF*D1, HP*2M, ABO*B, RH*D- e CA2*2, foram encontrados com freqüências elevadas, de acordo com o esperado para populações com origem predominantemente africana. As estimativas de mistura racial indicaram que o percentual de contribuição africana em Curiau (74%) é maior do que em Pacoval (44%) e que em Curiau não foi detectada mistura com indígenas. As estimativas de ancestralidade africana estão de acordo com o grau de isolamento e com a mobilidade das comunidade estudadas. Pacoval apresenta um elevado percentual de imigrantes entre os pais e avós dos individuos estudados, enquanto que a comunidade de Curiau, apesar de situada na região metropolitana de Macapá, apresenta uma pequena proporção de imigrantes, sugerindo a existência de uma barreira relativamente forte contra a mistura interétnica. A análise dos dados genéticos foi também efetuada em sub-amostras constituídas apenas por indivíduos cujos pais e avós nasceram na localidade em estudo e que provavelmente representam essas populações duas gerações atrás. Os resultados indicaram que a mistura com não-negros nas duas populações não é um evento recente.