Heterodera glycines Ichinohe, o nematóide de cisto da soja (SCN), foi detectado no Brasil em 1.992 e desde então tem provocado perdas consideráveis à produtividade da soja brasileira. Populações de SCN apresentam grande diversidade genética, o que dificulta o manejo dessa cultura em áreas infestadas. Os objetivos desta pesquisa foram investigar a possível variação genética de dezesseis populações de SCN amostradas nas regiões Centro Oeste e Sudeste do Brasil, utilizando a técnica do RAPD (amplificação casualizada de DNA polimórfico), bem como estabelecer marcadores RAPD específicos para a raça 3 do SCN. Nossos resultados mostraram que os marcadores RAPD podem ser utilizados em estudos de variabilidade genética entre populações de SCN e dentro de raças deste nematóide, bem como podem ser usados no monitoramento de dinâmica populacional deste patógeno. O "primer" OPA-07 foi considerado satisfatório como marcador molecular para a raça 3, enquanto a análise eletroforética dos fragmentos de DNA amplificados com a utilização do "primer" OPA-10 detectou ligeira variação nas populações de SCN identificadas como raça 3. A população do SCN oriunda de Chapadão do Céu, GO - amostra 2 - foi a geneticamente mais distante, quando comparada às demais usadas neste estudo.
