Rtabnetsp: pacote R para extração de indicadores de saúde do estado de São Paulo

Morais, João Henrique de Araújo; Konstantyner, Thais Cláudia Roma de Oliveira; Fazenda, Álvaro Luiz; Sala, Arnaldo; Martins, Camila Bertini

doi:10.1590/S1679-4974202100020

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Epidemiologia e Serviços de Saúde

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Sumário

Ferramentas para gestão da vigilância em saúde • Epidemiol. Serv. Saúde 30 (1) • Jan-Dec 2021 • https://doi.org/10.1590/S1679-4974202100020 copiar

Rtabnetsp: pacote R para extração de indicadores de saúde do estado de São Paulo^* * Artigo derivado de monografia de conclusão de curso intitulada ‘Desenvolvimento de aplicativo R/Shiny para auxílio na visualização e análise de indicadores e análise de indicadores de saúde no estado de São Paulo’, apresentada por João Henrique de Araújo Morais junto ao Curso de Ciência da Computação da Universidade Federal de São Paulo, em 2019.

Rtabnetsp: paquete R para extracción de indicadores de salud del estado de São Paulo, Brasil

Autoria SCIMAGO INSTITUTIONS RANKINGS

Resumo

Indicadores de saúde representam uma importante ferramenta de acompanhamento de desempenho de ações em Saúde Pública, permitindo a avaliação de intervenções realizadas, bem como a identificação de tendências e regiões prioritárias para alocação de recursos. Com o objetivo de aumentar a praticidade nas tarefas de análise e manipulação de dados desses indicadores, foi criado um pacote R. O pacote rtabnetsp realiza requisições aos servidores TabNet da página eletrônica da Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo, recuperando e tratando tais dados para utilização do usuário. Este artigo apresenta o pacote rtabnetsp e suas funções, modo de instalação e uso; traz também exemplos de suas funcionalidades, que permitem a visualização, busca e seleção, entre uma lista de indicadores, do conteúdo desejado, além da obtenção dos dados agregados pelo nível de regionalização disponível na matriz de dados, conferindo maior agilidade a tarefas de gestão em saúde do estado de São Paulo.

Palavras-chave:
Software; Processamento Eletrônico de Dados; Indicadores Básicos de Saúde; Sistemas de Informação em Saúde; Gestão em Saúde

Número identificador (ID) no pacote	Nome do indicador	Número de subindicadores	Período disponível
1	1b - População segundo a Fundação Sistema Estadual de Análise de Dados de São Paulo (SEADE)	1	2000-2020
2	2 - Densidade demográfica segundo o Censo Demográfico da Fundação Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE)	3	2000-2010
3	3 - Grau de urbanização segundo o Censo Demográfico da Fundação Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE)	3	2000-2010
4	4 - Taxa de crescimento populacional (2000-2010) segundo o Censo Demográfico da Fundação Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE)	3	2010-2010
5	5 - Proporção de idosos	3	2000-2018
6	6 - Taxa bruta de natalidade	3	2000-2018
7	7 e 8 - Percentual de municípios com menos de 10 mil e com mais de 100 mil habitantes	2	2010-2018
8	Proporção (%) de municípios nos grupos 4 e 5, segundo Região de Saúde, DRS e RRAS do estado de São Paulo - 2008 a 2014 - versão 2016	1	2008-2014
9	10 - Produto interno bruto (PIB) per capita em reais (R$) corrente	3	2000-2017
10	11 a 13 - Taxa de mortalidade infantil e componentes	11	2000-2019
11	14 - Razão de mortalidade materna	3	2000-2018
12	15 a 17 - Taxa de mortalidade por neoplasias	47	2000-2019
13	18 - Taxa de mortalidade por doenças do aparelho circulatório	6	2000-2019
14	19 - Taxa de mortalidade por causas externas	17	2000-2019
15	20 a 23 - Percentual de óbitos por causas definidas	18	2000-2019
16	24 e 25 - Percentual de nascidos vivos com baixo peso ao nascer	5	2000-2019
17	26 - Percentual de partos em menores de 20 anos de idade	3	2000-2018
18	27a - Taxa de letalidade por formas graves de dengue (FHD + SCD + DCC)	3	2000-2011
19	27b - Taxa de letalidade de dengue	3	2012-2018
20	28 - Taxa de incidência de aids	3	2000-2018
21	29 - Taxa de incidência de sífilis congênita	3	2007-2018
22	30 - Prevalência de pacientes em diálise	3	2000-2017
23	31a - Leitos-SUS por 1.000 (mil) habitantes	3	2005-2019
24	31b - Leitos-SUS por 1.000 (mil) habitantes na população SUS-dependente	3	2005-2017
25	32 - Percentual de leitos-SUS em unidades de terapia intensiva (UTI)	3	2014-2019
26	33 - Cobertura da Atenção Básica em Saúde	3	2006-2018
27	34 - Cobertura de agente comunitário de saúde (ACS)	3	2000-2017
28	35 - Proporção de nascidos vivos de mães com 7 ou mais consultas de pré-natal	3	2000-2019
29	36a - Percentual de internação SUS na população total residente	3	2000-2018
30	36b - Percentual de internação SUS na população total residente para a população SUS-dependente	3	2000-2018
31	37a - Razão de exames citopatológicos do colo do útero em mulheres de 25 a 64 anos de idade	4	2008-2019
32	37b - Razão de exames citopatológicos do colo do útero em mulheres de 25 a 64 anos de idade na população SUS-dependente	4	2008-2019
33	38 - Cobertura vacinal tetravalente (até 2012) e pentavalente (a partir de 2013) em menores de 1 ano de idade	3	2000-2018
34	39 - Média de consultas médicas por habitante nas especialidades básicas	3	2000-2017
35	40 - Proporção de consultas de urgência por consulta básica	3	2000-2017
36	41 - Cobertura de 1ª consulta odontológica programática	3	2000-2016
37	42 - Percentual de internação por condições sensíveis à Atenção Básica em saúde (ICSAB)	3	2000-2018
38	43 - Taxa de internação por acidente vascular cerebral (AVC) em maiores de 40 anos de idade	3	2000-2019
39	44 - Taxa de internação hospitalar por fratura de fêmur em maiores de 60 anos de idade	3	2000-2018
40	45a - Percentual de partos cesáreos - Total (Sistema de Informações sobre Nascidos Vivos [Sinasc])	3	2000-2018
41	45b - Percentual de partos cesáreos pelo SUS (Sistema de Informações Hospitalares [SIH/SUS])	4	2000-2018
42	46 - Cobertura de Centro de Atenção Psicossocial (CAPS)	9	2012-2018
43	47a - Cobertura da Saúde Suplementar	3	2000-2019
44	47b - Estimativa da população SUS-dependente (com base na Saúde Suplementar)	4	2000-2019
45	48 - Proporção de cura de casos novos de tuberculose pulmonar bacilífera	3	2000-2018
46	49 - Proporção de cura de casos novos de hanseníase diagnosticados	3	2001-2017
47	50 a 52 - Índice de qualidade do tratamento da água nos parâmetros: bacteriológico, cloro e flúor	9	2008-2016
48	53 - Despesa em saúde per capita	3	2000-2017
49	54a - Razão de mamografia de rastreamento em mulheres de 50 a 69 anos de idade	4	2010-2018

Pacote	Hiperlink	Função
httr	https://cran.r-project.org/web/packages/httr/httr.pdf	Realização das requisições HTTP ao servidor do TabNet
xml2	https://cran.r-project.org/web/packages/xml2/xml2.pdf	Scraping das páginas
rvest	https://cran.r-project.org/web/packages/rvest/rvest.pdf	Scraping das páginas
stringi	https://cran.r-project.org/web/packages/stringi/stringi.pdf	Manipulação de texto e tratamento de codificação para o padrão Windows-1252 (https://encoding.spec.whatwg.org/#windows-1252)
purrr	https://cran.r-project.org/web/packages/purrr/purrr.pdf	Tratamento de exceções nas requisições HTTP
tidyr	https://cran.r-project.org/web/packages/tidyr/tidyr.pdf	Manipulação e tratamento de dados
dplyr	https://cran.r-project.org/web/packages/dplyr/dplyr.pdf	Manipulação e tratamento de dados
ggplot2	https://cran.r-project.org/web/packages/ggplot2/ggplot2.pdf	Construção de gráficos coropléticos simples, a partir dos dados obtidos
sf	https://cran.r-project.org/web/packages/sf/sf.pdf	Representação cartográfica
RColorBrewer	https://cran.r-project.org/web/packages/RColorBrewer/RColorBrewer.pdf	Paleta de cores, para representação cartográfica

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[1] Endereço para correspondência: João Henrique de Araujo Morais - Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca, Fundação Oswaldo Cruz, Rua Leopoldo Bulhões, nº 1480, Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil. CEP: 21041-210. E-mail: joao.tlp@gmail.com