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Genômica populacional e introgressão gênica em rebanhos caprino naturalmente adaptado ao Brasil

RESUMO

Objetivou-se aplicar Chip SNP caprinos 50 K da Illumina para analisar a estrutura genômica populacional em dois rebanhos de caprinos Marota, um particular e outro de conservação oficial, localizados no Piauí, e na investigação de indícios de erosão genética provocada pela raça Anglonubiana nesses rebanhos. Para isso, 86 animais Marota e 10 Anglonubianos foram genotipados. A diversidade genética foi analisada comparando-se alelos de menor frequência (MAF) nos rebanhos. A estrutura populacional e diferenciação genética foram avaliadas utilizando-se abordagem bayesiana, análise de componentes principais (PCA) e o índice de fixação (FST). A diferenciação genética alta (FST = 0,16) foi observada na população Marota em relação à população Anglonubiana. O rebanho particular compartilhou maior número de SNPs fixados com o rebanho Anglonubiano (1024) do que o rebanho de conservação oficial (741). Os resultados da PCA, juntamente com os da análise do Structure, mostraram a presença de genes Anglonubianos nos rebanhos Marota. Logo, conclui-se que elevado nível de polimorfismo e diferenciação genética alta entre caprinos Marota e Anglonubianos caracterizam esses animais como fonte de diversidade genética para a caprinocultura da região; o Chip SNP caprino 50 K da Illumina mostra-se eficiente para análise de estrutura populacional em caprinos Marota; as tecnologias de microarranjos, análises do programa Structure e Análise de Componentes Principais se complementam para ampliar a capacidade de detecção de introgressão gênica em pequenas populações; há indício de introgressão gênica da raça Anglonubiana nos rebanhos de caprinos Marota analisados.

Palavras-chave:
Chip SNP; Estrutura populacional; Recursos genéticos

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