The identification of suitable internal reference genes in quinoa seeds subjected to abscisic acid and gibberellin treatment

Resumo:

A quinoa foi reconhecida como a única “cultura nutricional abrangente”; no entanto, é suscetível à germinação na pré-colheita (BHS). Embora a reação em cadeia da polimerase com transcrição reversa quantitativa (RT-qPCR) tenha sido amplamente empregada para detecção do nível de expressão gênica, a seleção de genes de referência adequados é essencial para garantir a quantificação precisa da expressão gênica em diversas condições. Este estudo tem como objetivo identificar genes de referência estáveis em sementes de quinoa tratadas com ABA e GA, a fim de fornecer uma base para pesquisas subsequentes em BPC. As sementes foram submetidas a diferentes concentrações de ABA e GA (10 μM, 50 μM, 100 μM e 200 μM). A concentração de tratamento mais adequada foi determinada com base na viabilidade das sementes. MON1, GAPDH, EIF3, EF1α, ACT, TUB1 e TUB6 foram selecionados como genes candidatos. A adequação destes genes de referência sob diferentes condições foi avaliada utilizando vários métodos, incluindo valores Ct, geNorm, NormFinder, BestKeeper, Delta Ct e RefFinder. Com base nos resultados obtidos nos experimentos com hormônios, observou-se que a aplicação de 100 μM de ABA e 200 μM de GA produziu os resultados mais vantajosos. Além disso, os genes de referência mais apropriados para diferentes tratamentos são ACT e TUB1 (tratamento com H₂O), EIF3 e MON1 (tratamento com ABA, GA e para o conjunto de dados combinados dos três grupos). No entanto, o GAPDH exibiu a menor estabilidade em todos os tratamentos. Em resumo, o ACT é recomendado como gene de referência para a germinação natural da quinoa, enquanto o EIF3 e o MON1 devem ser utilizados para os tratamentos com ABA e GA.

Termos para indexação:
ABA, Chenopodium quinoa Willd.; GA, gene de referência, RT-qPCR