Uma coleção nuclear de pupunha na Amazônia brasileira

O Banco Ativo de Germoplasma de Pupunha tem abundante diversidade genética em seu acervo. Por ser uma coleção viva, os recursos financeiros para caracterizar e avaliar são escassos, restringindo seu uso. Uma forma de promover o uso eficiente é criar uma coleção nuclear, um conjunto de acessos com pelo menos 70% da diversidade genética da coleção inteira, com repetição mínima. As informações geográfica, molecular e morfométricas foram sistematizadas e as populações silvestres e domesticadas estratificadas. A coleção nuclear é constituída por 10% de toda a coleção: 31 amostras de raças primitivas, cinco amostras de populações não-designadas e quatro amostras de populações silvestres. A coleção tem 92% de polimorfismo molecular e 95% da heterozigosidade do banco inteiro, com um mínimo de divergência entre elas por variância molecular e já está recebendo prioridade em manutenção, o que irá contribuir para a conservação em longo prazo

Distribuição geográfica; variação molecular; manejo de germoplasma; recursos genéticos

Autoria

Michelly de Cristo-Araújo ^**E-mail: michelly_araujo@yahoo.com.br

Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Av. André Araújo, 2936, Petrópolis, 69.060-001, Manaus, AM, Brazil.Instituto Nacional de Pesquisas da AmazôniaBrazilManaus, AM, BrazilInstituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Av. André Araújo, 2936, Petrópolis, 69.060-001, Manaus, AM, Brazil.

Universidade Federal do Amazonas (UFAM), Instituto de Ciências Biológicas, Laboratório de Evolução Aplicada, Av. Gal. Rodrigo Otávio Jordão Ramos, 3000, Coroado, 69.077-000, Manaus, AM, BrazilUniversidade Federal do AmazonasBrazilManaus, AM, BrazilUniversidade Federal do Amazonas (UFAM), Instituto de Ciências Biológicas, Laboratório de Evolução Aplicada, Av. Gal. Rodrigo Otávio Jordão Ramos, 3000, Coroado, 69.077-000, Manaus, AM, Brazil

Doriane Picanço Rodrigues

Spartaco Astolfi-Filho

UFAM, Centro de Apoio MultidisciplinarUFAMBrazilBrazilUFAM, Centro de Apoio Multidisciplinar

Charles R. Clement

*E-mail: michelly_araujo@yahoo.com.br

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Figuras | Tabelas

Figuras (3)
Tabelas (2)

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Figure 1
Distribution of wild populations (var. chichagui, types 1, 2 and 3) and domesticated landraces (var. gasipaes) of peach palm (Bactris gasipaes), and Core Collection samples within the Peach palm Active Germplasm Bank maintained at INPA, Manaus, Amazonas, Brazil. Landraces are: microcarpas (1) Pará and (2) Juruá; mesocarpas (3) Pampa Hermosa, (4) Tigre, (5) Pastaza, (6) Inirida, (7) Cauca and (8) Utilis; macrocarpas (9) Putumayo and (10) Vaupés.

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Figure 2
Representativeness of the Core Collection within the Peach palm Active Germplasm Bank in terms of number of accessions per landrace and population. Populations are arranged from east (Pará) to west (Utilis) (see Figure 1).

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Figure 3
Evaluation of the distribution of the Core Collection in the multivariate space of the Peach palm BAG by Principal Coordinate Analysis of the four matrices generated with RAPD markers that could not be combined for a single analysis: (A) Rodrigues et al. (2004)R Core Team (2013) R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. Available at < http://www.R-project.org/>.
http://www.R-project.org/... , (B) Silva et al. (2003)Silva CC, Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2003) Análise molecular e validação de raças primitivas de pupunha (Bactris gasipaes) por meio de marcadores RAPD. Relatório de projeto, Banco da Amazônia, Fundação Djalma Batista, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus. , (C) Cristo-Araújo et al. (2010)Clement CR, Weber JC, van Leeuwen J, Astorga-Domian C, Cole DM, Arévalo-Lopez LA and Argüello H (2004) Why extensive research and development did not promote use of peach palm fruit in Latin America. Agroforestry Systems 61: 195-206. , and (D) Santos et al. (2011)Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2004) Molecular marker-mediated validation of morphologically deﬁned landraces of Pejibaye (Bactris gasipaes) and their phylogenetic relationships. Genetic Resources and Crop Evolution51: 871-882.. CC = black points; BAG = gray points.

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Table 1
Accessions of domesticated and wild populations included in the Core Collection within the Peach palm Active Germplasm Bank. Class - domesticated vs wild; Race/pop - designation of landrace or other taxonomic unit; BAG - number of accessions currently in the BAG; CC - number of accessions designated to the Core Collection; geographical location of the accessions in Brazil (BR), Colombia (CO), Costa Rica (CR), Ecuador (EC), Panama (PA), Peru (PE); No. id. - INPA identification codes

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Table 2
Genetic parameters of the Peach palm Active Germplasm Bank (BAG) and Core Collection (CC) estimated from four data matrices ENT#091;Rodrigues et al. (2004)R Core Team (2013) R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. Available at < http://www.R-project.org/>.
http://www.R-project.org/... , Silva et al. (2003)Silva CC, Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2003) Análise molecular e validação de raças primitivas de pupunha (Bactris gasipaes) por meio de marcadores RAPD. Relatório de projeto, Banco da Amazônia, Fundação Djalma Batista, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus. , Cristo-Araújo et al. (2010Clement CR, Weber JC, van Leeuwen J, Astorga-Domian C, Cole DM, Arévalo-Lopez LA and Argüello H (2004) Why extensive research and development did not promote use of peach palm fruit in Latin America. Agroforestry Systems 61: 195-206. ), Santos et al. (2011Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2004) Molecular marker-mediated validation of morphologically deﬁned landraces of Pejibaye (Bactris gasipaes) and their phylogenetic relationships. Genetic Resources and Crop Evolution51: 871-882.)ENT#093; that could not be combined for a single analysis, with summary of the AMOVA. P = polymorphism, He = expected heterozygosity (assuming absence as recessive), Hs = average panmitic heterozygosity, Ht = panmitic heterozygosity based on allele frequency, θ-I (Theta-I) = divergence (similar to Fst); Gst-B = Bayesian version of Nei's Gst.

Figure 1 Distribution of wild populations (var. chichagui, types 1, 2 and 3) and domesticated landraces (var. gasipaes) of peach palm (Bactris gasipaes), and Core Collection samples within the Peach palm Active Germplasm Bank maintained at INPA, Manaus, Amazonas, Brazil. Landraces are: microcarpas (1) Pará and (2) Juruá; mesocarpas (3) Pampa Hermosa, (4) Tigre, (5) Pastaza, (6) Inirida, (7) Cauca and (8) Utilis; macrocarpas (9) Putumayo and (10) Vaupés.

Figure 2 Representativeness of the Core Collection within the Peach palm Active Germplasm Bank in terms of number of accessions per landrace and population. Populations are arranged from east (Pará) to west (Utilis) (see Figure 1).

Figure 3 Evaluation of the distribution of the Core Collection in the multivariate space of the Peach palm BAG by Principal Coordinate Analysis of the four matrices generated with RAPD markers that could not be combined for a single analysis: (A) Rodrigues et al. (2004)R Core Team (2013) R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. Available at < http://www.R-project.org/>.
http://www.R-project.org/... , (B) Silva et al. (2003)Silva CC, Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2003) Análise molecular e validação de raças primitivas de pupunha (Bactris gasipaes) por meio de marcadores RAPD. Relatório de projeto, Banco da Amazônia, Fundação Djalma Batista, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus. , (C) Cristo-Araújo et al. (2010)Clement CR, Weber JC, van Leeuwen J, Astorga-Domian C, Cole DM, Arévalo-Lopez LA and Argüello H (2004) Why extensive research and development did not promote use of peach palm fruit in Latin America. Agroforestry Systems 61: 195-206. , and (D) Santos et al. (2011)Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2004) Molecular marker-mediated validation of morphologically deﬁned landraces of Pejibaye (Bactris gasipaes) and their phylogenetic relationships. Genetic Resources and Crop Evolution51: 871-882.. CC = black points; BAG = gray points.

Table 1 Accessions of domesticated and wild populations included in the Core Collection within the Peach palm Active Germplasm Bank. Class - domesticated vs wild; Race/pop - designation of landrace or other taxonomic unit; BAG - number of accessions currently in the BAG; CC - number of accessions designated to the Core Collection; geographical location of the accessions in Brazil (BR), Colombia (CO), Costa Rica (CR), Ecuador (EC), Panama (PA), Peru (PE); No. id. - INPA identification codes

Table 2 Genetic parameters of the Peach palm Active Germplasm Bank (BAG) and Core Collection (CC) estimated from four data matrices ENT#091;Rodrigues et al. (2004)R Core Team (2013) R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. Available at < http://www.R-project.org/>.
http://www.R-project.org/... , Silva et al. (2003)Silva CC, Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2003) Análise molecular e validação de raças primitivas de pupunha (Bactris gasipaes) por meio de marcadores RAPD. Relatório de projeto, Banco da Amazônia, Fundação Djalma Batista, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus. , Cristo-Araújo et al. (2010Clement CR, Weber JC, van Leeuwen J, Astorga-Domian C, Cole DM, Arévalo-Lopez LA and Argüello H (2004) Why extensive research and development did not promote use of peach palm fruit in Latin America. Agroforestry Systems 61: 195-206. ), Santos et al. (2011Rodrigues DP, Astolfi-Filho Sand Clement CR (2004) Molecular marker-mediated validation of morphologically deﬁned landraces of Pejibaye (Bactris gasipaes) and their phylogenetic relationships. Genetic Resources and Crop Evolution51: 871-882.)ENT#093; that could not be combined for a single analysis, with summary of the AMOVA. P = polymorphism, He = expected heterozygosity (assuming absence as recessive), Hs = average panmitic heterozygosity, Ht = panmitic heterozygosity based on allele frequency, θ-I (Theta-I) = divergence (similar to Fst); Gst-B = Bayesian version of Nei's Gst.

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