Estuários são áreas de reconhecida importância no desenvolvimento e refúgio dos peixes e também grande fonte de recursos pesqueiros. Este artigo apresenta um inventário dos peixes do estuário do Rio Paraguaçu, Baía de Todos os Santos, Bahia, Brasil. 28 pontos constituindo as três seções salinas que pode haver em um estuário tropical foram amostradas trimestralmente de março de 2009 a fevereiro de 2010 com auxílio de redes de espera de fundo, de superfície, redes de arrasto manual e tarrafas. Um total de 4.097 indivíduos foram capturados, pertencendo a 7 espécies de Chondrichthyes e 117 espécies de Actinopterygii (83 gêneros e 49 famílias). A maioria da extensão territorial do estuário foi amostrada para acessar maior variabilidade espacial na estrutura da assembléia de peixes. A curva de acumulação de espécies (rarefação) apresentou estabilização com ½ das amostras. A estrutura geral da assembléia é descrita e comentada através de evidências para uma nova organização espacial da fauna de peixes devido a efeitos de barragem a montante do estuário.
inventário; peixes estuarinos; distribuição espacial; efeitos a montante; nordeste brasileiro
