Este estudo teve como objetivo comparar as comunidades bacterianas de amostras de água de formação e de óleo de reservatórios de petróleo brasileiros com diferentes graus de biodegradação usando a técnica de PCR-DGGE. O DNA ambiental foi isolado e empregado em reações de PCR com primers bacterianos, com subseqüente separação dos fragmentos de DNAr 16S em DGGE. Os produtos de PCR foram também clonados e seqüenciados, visando à afiliação taxonômica dos membros da comunidade. Os fingerprints obtidos permitiram a comparação direta entre as comunidades bacterianas das amostras de óleo com diferentes graus de biodegradação, assim como entre as comunidades da água de formação e do óleo do reservatório não biodegradado. Perfis de DGGE muito similares foram observados para todas as amostras, e a diversidade dos filotipos bacterianos predominantes mostrou-se baixa. Os resultados de clonagem e seqüenciamento revelaram diferenças mais significativas entre as amostras de água de formação e de óleo do reservatório não biodegradado. Bacillus sp. e Halanaerobium sp. mostraram-se os componentes predominantes da comunidade bacteriana da presente na amostra de água de formação, ao passo que a amostra de óleo incluiu também Alicyclobacillus acidoterrestris, Rhodococcus sp., Streptomyces sp. e Acidithiobacillus ferrooxidans. A técnica de PCR-DGGE, combinada com clonagem e seqüenciamento dos produtos de PCR, revelou a presença de grupos taxonômicos não encontrados anteriormente nestas amostras quando métodos baseados em cultivo e na construção de bibliotecas de genes RNAr 16S foram utilizados, evidenciando a necessidade de um estudo polifásico a fim de contribuir para o conhecimento da diversidade microbiana em ambientes extremos como reservatórios de petróleo.
Diversidade bacteriana; comunidade de DNA; análise independente de cultivo; petróleo; 16S rDNA
