Este estudo prospectivo randomizado, duplo-cego, fatorial teve como objetivo comparar a eficácia de três diferentes medicamentos intracanal com o placebo no controle da dor pós-operatória após a preparação completa do canal radicular. O estudo foi realizado em 64 molares inferiores de 64 pacientes com diagnóstico de necrose pulpar e periodontite apical aguda. Após os procedimentos químico-mecânicos com a técnica escalonada (stepback) e hipoclorito de sódio a 1%, os dentes foram divididos aleatoriamente em quatro grupos de tratamento (n=16 por grupo). No grupo I, os canais foram preenchidos com pasta de hidróxido de cálcio misturado com 2% de clorexidina gel, grupo II receberam 2% de clorexidina gel, grupo III foi tratado com uma pasta de hidróxido de cálcio e do grupo IV não receberam curativo (controle). Antes de liberar o paciente, a sensação de dor pré-operatória foi registrada com uma escala visual analógica. Os pacientes foram instruídos para quantificar o grau de dor experimentada após 4 h de tratamento e diariamente após 24, 48, 72 e 96 h. Os testes ANOVA a dois critérios para medidas repetidas e teste de Tukey post hoc HSD revelaram que, a cada intervalo de tempo, o grupo I e grupo II foram significativamente mais (p<0,05) eficazes na redução da dor pós-operatória que os grupos III e IV. Além disso, o teste de Dunnett mostrou que o grupo I e grupo II diferiram significativamente com o controle enquanto que a diferença entre o grupo III e controle foi não significativo. Pacientes com necrose pulpar e periodontite apical aguda que receberam curativos de demora de clorexidina e hidróxido de cálcio mais clorexidina apresentaram menos dor do que aqueles que receberam curativo de hidróxido de cálcio ou não receberam qualquer curativo.